本发明公开了一种基于模因优化的多目标端元识别方法，包括：获取待识别端元的原始高光谱图像；根据原始高光谱图像的数据，基于纯像元假设采用顶点成分分析修剪高光谱图像的像元构造自词典；基于所述自词典构建高光谱图像端元识别的多目标优化模型；基于模因优化算法获得所述多目标优化问题模型的非支配解集；利用所述多目标优化问题模型的非支配解集，基于膝点法确定最优端元组合。本发明可以综合演化算法的全局搜索能力和局部搜索算子的局部寻优能力，提升端元识别的精度和效率，同时还可以根据膝点法从非支配解集中确定最优端元组合。