本发明涉及一种双层载药球囊导管，包括外管、内管、内球囊及外球囊；其中，内球囊设有阵列排列的若干凸起；外球囊套设于内球囊外，外球囊的两端分别与内球囊的两端固接，使得外球囊随内球囊的充盈而扩张；外球囊的外表面设有数条沿轴向延伸的棘突；外球囊的表面还覆盖有药物涂层。通过向内球囊注射造影剂使其充盈，同时可以使得外球囊及外球囊上的棘突受到径向支撑的力而扩张，进而嵌入到血管内壁病变处斑块中，加强药物的释放效果，提升了药物的输送效率；进一步地，内球囊上设置的凸起结构不仅可以使外球囊快速扩张，而且加强了外球囊与血管壁的贴合性，提高了手术效率，且有效减小了手术风险。