本发明提供一种列车折返的控制方法及系统，方法包括：当列车处于无人折返中的折出阶段时，根据控车算法控制折出阶段的启车阶段以及惰行巡航阶段的列车运行，并判断是否接收到轨道上的应答器发送的信号；若是，则在确定列车的当前速度大于最小通过速度，以及列车处于CM模式的情况下，向ZC发送快速解锁命令，直至满足命令发送终止条件时，停止向ZC发送快速解锁命令；根据控车算法，控制列车停在无人折返停车点。本发明通过增加应答器，并在列车检测到应答器发送的信号、列车处于自动防护CM模式以及列车当前速度大于最小通过速度时，则提前通知ZC完成道岔转动操作并出清道岔可动区域占用，提高列车通过无人折返区域的折返效率。