本发明公开了一种磷石膏基缓释氮肥及其制备方法。制备方法包括以下步骤：将磷石膏与氮源混合均匀后，置于球磨罐内，充分研磨，干燥后，得到第一固体混合物；将第一固体混合物、无机粘结剂、有机粘结剂混合均匀后，加入一定量水，并快速搅拌成团，经挤压造粒、干燥后，得到第二固体混合物；将第二固体混合物与双亲有机改性剂、无机增强剂及氮源形成的悬浮液混合均匀，经过滤、烘干，得到第三固体混合物；将有机包膜剂熔融，并加入第三固体混合物，充分混匀、包膜后，得到磷石膏基缓释氮肥。本发明通过构建内核‑改性‑有机包膜体系，改善了传统有机包膜剂与无机内核间相容性差、易开裂等问题，显著延缓了磷石膏基缓释氮肥中氮素的释放。