本发明公开了一株具有溶藻功能的凝结芽孢杆菌，菌株名为Bacillus coagulans YZ‑12，保藏号为CGMCC No.23994，所述凝结芽孢杆菌可以抑制或杀灭蓝藻、应用于治理水产养殖过程中的蓝藻藻华现象，可以抑制的蓝藻包括铜绿微囊藻、鱼腥藻、颤藻、水华束丝藻、聚球藻中的一种或多种组合。所述凝结芽孢杆菌作用温度范围为15‑40℃；使用pH范围为4.0~10.0；使用水环境的溶解氧范围为≥1 mg/L；使用光照条件0~10000 lux。