本申请提供一种轴承润滑系统运行方法、旋转设备以及计算机可读存储介质，轴承润滑系统运行方法包括：控制循环泵工作，以使低位油箱内的润滑介质流动至高位油箱内；控制高位油箱内的润滑介质流入润滑油箱内，以对润滑油箱内的轴承进行喷淋润滑；控制润滑油箱内的润滑介质回流低位油箱内，以在循环泵工作过程中，高位油箱和低位油箱内润滑介质的液位大于预设液位，且润滑油箱内润滑介质液位接近或等于0。本申请实现了润滑油箱零液位润滑，因此可以避免润滑油箱因轴相对于轴承的转动而产生的泡沫以及油雾现象。