本发明提供了一种水分仪的管理系统及其方法，属于烟盒除湿技术领域，该一种水分仪的管理系统包括第一获得模块、异常判断模块、第二获得模块、准确性判断模块和权限处理模块，所述第一获得模块用于接收烘箱数据并进行计算，得到烟盒实际水分值；其中，所述烘箱数据包括烟盒在线水分值；所述异常判断模块用于比较所述烟盒在线水分值和所述烟盒实际水分值，并判断所述烟盒在线水分值是否存在异常；其中，若存在异常，则执行下一步骤；所述第二获得模块用于接收水分仪参数进行整理并储存；通过设置的准确性判断模块，判断结果为斜率在正常范围之外时，确定单元需重新确定零点参数，以确保水分仪的准确度，从而保证数据真实有效。