本发明公开了一种燃料电池空气系统及其压力控制方法，系统电堆、空压机、出口阀、背压阀、电流采集模块和控制模块；电堆的空气出口、出口阀和背压阀依次连接；所述空压机连接电堆的空气入口；所述电流采集模块连接电堆和所述控制模块；所述控制模块连接出口阀和背压阀；所述电流采集模块用于实时检测电堆的电流，并将电流值发送给所述控制模块；所述控制模块根据电流采集模块的实时电流和实际空气入口压力，控制出口阀和背压阀的开度。本发明通过出口阀和背压阀联合控制电堆空气出口侧的压力，有效降低电堆阴极空气流量与压力控制的耦合作用，提高压力控制稳定性。