本发明属于口腔清洁产品领域，具体的公开了一种牡丹根皮提取物抑菌爆珠及其制备方法和应用。所述牡丹根皮提取物抑菌爆珠包含有以下原料：含有牡丹根皮提取物的有效成分和辅料，所述有效成分包括：含有牡丹根皮提取物的天然植物提取成分、含有乳酸菌的复合益生菌、尿囊素、麦芽寡糖葡糖苷、木糖醇、氟化钙、维生素C、月桂醇磺基乙酸钠；所述辅料包括：甘油、山梨醇、海藻酸钠、碳酸钙和壳聚糖。本发明具有广谱抑菌作用，以及优秀的除口臭能力以及缓解口腔癌患者疼痛和不适感，本品携带和使用方便，制备方法简便，生产成本低，具有很强的实用性和独创性，针对口腔癌患者，能够满足他们在口腔护理方面的迫切需求，具有良好的产业化前景。