一种综合管控机制的变电站配置文件管控系统及方法。设计的管控系统包含用户登录、项目工程创建、配置文件资料交互、配置文件服务、综合管控5个模块，其中配置文件资料交互模块能够与配置文件服务、综合管控两个模块联动。综合管控主要包括配置文件的正确率、资料提交及时率和工程资料正确率三个考核项目。此外，还依据发明的系统设计了配置文件管控的作业方法，将多方纳入考评机制，并量化在不同环节、不同缺陷项目的扣分情况，能够将不同承担方对于配置文件的管控效果以具体评分展示出来。本发明以完整的系统和方法，可实现智能变电站配置文件的闭环管控，整体提高配置文件管控效率及水平。