本发明公开了电力系统继电保护技术领域的一种自适应缓存深度的无线差动同步系统及方法，包括：与对侧线路保护装置进行各采样点同步采样与序号同步；向对侧线路保护装置发送数据帧增加同步序号与时间戳；接收对侧线路保护装置发送的数据帧后，以所接收的数据帧中同步序号为标识存入本侧数据接收缓存中；根据当前时刻的同步序号分别读取本侧数据接收缓存同步数据与本侧接收同步数据对每个采样点进行差动保护处理。本发明通过实时监视通道延时状态，对消抖延时的设置进行优化，动态调整消抖延时，使得适应无线通信数据通道特征的前提下，最大限度保障继电保护的速动性，为5G差动保护业务的推广提供了重要的技术支撑。