本发明提供了一种基于同步测量数据的雅可比矩阵计算方法及系统，属于电力调度技术领域。所述计算方法包括：S1、获取电力系统电网拓扑数据；S2、利用同步相量测量单元获取电气参数；S3、构建电气参数变化量矩阵；S4、利用遗忘因子计算雅可比矩阵。本发明基于PMU实时测量数据和遗忘因子计算电力系统雅可比矩阵，能够适应来自网络拓扑结构、发电机组或负荷的快速扰动和变化而引起的电网参数的变化而快速准确地计算电力系统雅可比矩阵，解决了由于现有电力系统出力间歇性和随机性的特点造成的雅可比矩阵计算不准确的问题，确保电网的安全运行。