本发明提供了一种水电机组供油设备健康状态评估方法和系统，包括：获取水电机组在启停过程中待评估的供油设备状态参数以及与供油设备状态参数关联性超过预设阈值的机组运行状态参数和推力轴承状态参数；将所述与供油设备状态参数关联性超过预设阈值的机组运行状态参数和推力轴承状态参数输入预先构建的供油设备健康状态模型，根据模型输出的正常运行时的供油设备状态参数和待评估的供油设备状态参数对机组供油设备健康状态进行评估；本发明根据模型输出的正常运行时的供油设备状态参数和待评估的供油设备状态参数判断机组供油设备健康状态，可以及时发现供油设备的异常状态，并能及时对机组进行维护，避免设备出现故障，从而造成更大的经济损失。