本发明涉及电力传输技术领域，公开了一种模块化多电平储能换流器的控制方法、装置及换流器。本发明在原有模块化多电平储能换流器的拓扑结构上，在功率模块的电池组新并联了由晶体管和电阻串联而成的保护支路，并相应提供了该换流器的控制方法和装置，其中在系统正常运行时，向各功率模块发送脉冲宽度调制指令，同时控制保护支路中的晶体管保持断开状态，实时检测系统是否发生故障，在检测到系统发生故障时，控制保护支路中的晶体管导通。本发明新的拓扑结构相对于原方案，其功率模块具有更强的穿越系统故障的能力，避免电力电子设备因系统能量过充损坏，而且能够尽可能地减少故障期间功率模块的频繁投切，经济性较好，控制方法及装置简单便捷。