本发明提供了一种活性基团封端的聚酰胺齐聚物的制备方法，以环内酰胺作为主要原料，以去离子水、直链氨基酸或聚合度≤3的活性基团封端的聚酰胺齐聚物作为催化环内酰胺开环的催化剂，通过控制环内酰胺初步聚合反应合适的温度和时长，配合向体系中在特定时机引入开环保护剂和分子量调节剂，调控总体聚合反应时间等，从而调控获得的活性基团封端的聚酰胺齐聚物的分子量。本发明制备方法能够制备得到聚合度为2～20的封端纯度高的端羧基或端胺基封端的聚酰胺齐聚物。