本发明公开了一种模块化集装箱式生物安全隔离装备及其负压控制和气流组织方法，集装箱式生物安全隔离装备舱体内设置有暖通系统、空气净化消杀系统、舱内氧气保障系统、用电保障系统、医疗设备和智能监控系统使舱内具有丰富的电、气、氧、医疗和环境等保障设施，并采用“定送变排”的气流控制方式实现负压控制，满足传染病防治中的“上送下排”分区层流式定向气流组织的要求。通过将隔离装备内部区域划分为清洁区、半污染区和污染区，降低交叉感染的风险。整套装备采用集装箱作为舱体，集隔离、转运和救治功能为一体，具有较强的环境适应性。