本发明公开了一种探测河底泥沙层间声波反射系数的方法，步骤一，通过机械取样或计算获得第一层泥沙的泥沙参数；步骤二，将浅地层剖面仪的拖鱼设置在水面下2米处，并使拖鱼向上发射声波，得到水‑空气之间的反射波的幅值；步骤三，根据第一层泥沙参数计算获得第一层泥沙底部的反射系数。本发明可获取第二层泥沙波阻抗等参数，丰富淤积泥沙信息；仅利用浅底层剖面仪即可获取水底第二层泥沙的波阻抗等参数，节约人力物力，提高工作效率；为河流动力学和泥沙资源利用等研究提供数据支撑。