本发明涉及具有谐波、纹波补偿功能的电解制氢整流器及控制方法，属于利用电解水制氢技术领域，包括：主功率整流器、移相变压器、辅助变换器等。主功率整流器为并联型12脉波可控硅整流器，辅助变换器为基于buck型同步整流电路拓扑的三相单级双向AC/DC变换器，主功率整流器和辅助变换器并联连接，通过控制PWM信号驱动辅助变换器中的IGBT，辅助变换器根据谐波补偿指令值输入相应的谐波电流，进而保证对12脉波可控硅整流器输入电流谐波的有效抑制，同时根据纹波补偿指令值输出相应的纹波补偿电流，电解制氢整流器总输出为纯直流量。