本发明涉及无线通信技术领域，提供一种胶囊内窥镜系统，包括：第一至第N通信单元，第一至第N通信单元分别具有相应的通信范围，第一至第N通信单元的通信范围分别与第一至第N肠道段一一对应；第一胶囊内窥镜；第二胶囊内窥镜；便携式主控机，便携式主控机用于在第一胶囊内窥镜进入第i通信单元的通信范围内时，控制第i通信单元建立起与第一胶囊内窥镜的图像传输连接，依次通过第一至第N通信单元获取普通图像，便携式主控机还用于根据普通图像检出病灶并确定病灶所在的第j肠道段，并控制第j通信单元建立起与第二胶囊内窥镜的图像传输连接，通过第j通信单元获取高清图像。本发明能够可靠地获取病灶处的高清图像。