本申请涉及一种酸性矿山废水综合治理方法，其包括S1地质勘察、S2源头阻隔、S3径流阻断、S4末端治理；即通过对采空区进行填充，一定程度上阻隔采空区内的水‑氧‑微生物‑硫化矿物的生化反应，以减少地下水或者地表水渗入采空区内而形成酸性矿山废水，从源头上进行阻隔，减少矿山废水的持续产生，以减少大量且长时间的治理成本；同时利用石灰石沟渠进行径流阻断，能够调整矿山废水的pH值，并且采用人工湿地作为末端治理，治理效果佳，且人工湿地可以作为后续复绿的一部分，运行维护成本低。