本发明公开了一种高纯度艾考糊精的加工装置及其制备方法，所述脱色机构整体为内部中空，底部呈锥形的桶状结构，下方设有出料管道，并与所述脱色机构内部的脱色腔体相连通，所述出料管道上设有出料开关阀，所述超滤机构套设于所述脱色机构外侧，下方设有出液管道，并与所述超滤机构中的超滤腔体相连通，所述出液管道上设有出液开关阀；本发明发明人通过大量的实验以及经验，确定了制备艾考糊精的最优工艺组合，通过对淀粉水解过程中的工艺参数及原料的优选以及对水解反应进程的监控，超滤法进行分子量筛选，所得到的艾考糊精的分子量的分布范围更窄，分子量更集中，反应进程的监控方法简便且易于实现，最终所得艾考糊精粒度均匀且含水量低(≤9.5wt％)。整个制备方法简单易于实现工业化生产。