本发明涉及水热电联产技术领域，具体涉及一种水热电联产系统及其运行方法。水热电联产系统，包括：预热器组，其冷侧出口端连通有多效蒸发器组；冷凝器，其蒸汽入口与多效蒸发器组的蒸汽出口连通，其海水出口与预热器组的冷侧入口连通；加热器组，其末端连通有尖峰加热器，尖峰加热器的疏水出口与预热器组的热侧进口连通；冷凝器与多效蒸发器组之间还并联连通有第一喷射器和第二喷射器，第一喷射器的出口端与多效蒸发器组的蒸汽入口连通，第二喷射器的出口端与加热器组的蒸汽入口连通。充分利用了海水淡化过程中的低品位余热，能够大大降低供热成本，提升水热电联产系统的能量利用效率。