本发明公开了一种能耗数据处理方法、系统、设备及存储介质，所述方法包括：响应于检索请求查找有效的能耗数据；所述能耗数据包括计量对象、计量时段以及各计量时段所对应的能耗值；遍历每个计量对象的所有有效的能耗数据，判断同一计量对象是否存在计量时段发生交集的多个目标能耗数据，按照预设的单位时间对发生交集的每个所述目标能耗数据进行能耗值分摊，根据分摊结果统计并输出每个计量对象在各时段所对应的用电量。本发明对来自于人工录入或者第三方系统对接的不规则能耗增量数据进行自动分摊处理，保障在数据录入时段存在交叉、修改或删除已录入数据、数据分摊异常中断等场景下的能耗数据分摊计算正确，保障能耗统计分析所需的数据质量。