本发明提供了一种羧基化壳聚糖中空纱线及其制备方法，对壳聚糖纤维进行羧基改性，得到羧基化壳聚糖纤维；将羧基化壳聚糖纤维作为皮层，将纤维长丝作为芯层，进行包芯纺纱，得到羧基化壳聚糖纤维复合包芯纱；其中，纤维长丝的熔点低于羧基化壳聚糖纤维的起始热降解温度；将羧基化壳聚糖纤维复合包芯纱中的芯层长丝熔融去除，同时羧基化壳聚糖纤维中的C‑6位羟基被氧化为醛基，然后和氨基发生席夫碱交联反应，羧基和氨基通过静电作用也形成交联结构，提高皮层强度，得到羧基化壳聚糖中空纱线。本发明采用熔融去除的方法构造中空结构，可避免溶剂对壳聚糖纤维的浸泡解离和收缩现象，从而使得中空结构保存良好。