浅覆盖层的海上风电单桩复合基础施工方法及其复合基础。上述施工方法，包括以下步骤：S1，将支撑结构锚固于海床地基覆盖层；S2，将稳桩平台可拆卸地固定安装在支撑结构上；S3，将单桩移入稳桩平台的抱桩器内后，进一步下放单桩，单桩穿过导向筒并沉放至泥面；抱桩器抱紧单桩并调整单桩的桩身垂直度；S4，单桩打入至设计深度；S5，清除固定介质容置腔中的土体；之后，向固定介质容置腔内灌注用于连接单桩和支撑结构的固定介质，以形成单桩复合基础结构；S6，将稳桩平台从支撑结构上拆卸。通过上述结构可以有效地解决现有技术中得浅覆盖层、软土地基海床的施工成本高，且建设周期长的问题。