本发明公开了一种自适应迭代的位场分离方法、系统、设备及计算机可读存储介质，所述方法包括以下步骤：分析频谱与功率谱以确定计算滤波器所需参数的选择区间；迭代开始，用二分法从参数的选择区间自动搜索最优参数值并计算滤波器；根据滤波器进行频率域位场分离；对分离得到的异常进行位场反演计算；计算位场反演结果与先验信息之间的误差；判断误差是否满足迭代停止条，若满足，迭代停止，若不满足，则回到步骤4重新选择参数以达到自适应滤波。本发明能够根据给定的先验信息进行自适应迭代的位场分离，并得到与给定的先验信息相关的目标地质体的异常分离结果。