本发明提供一种适用于电力系统工程的决算数据处理方法及系统，包括：服务器接收对第一电力系统工程配置的决算请求、决算比对策略，调取数据库中与第一电力系统工程相对应的第一预算报表；根据时间比对周期和信息比对类型，提取第一预算报表内的第一预算信息，根据所提取的第一预算信息生成第一预算比对表；根据信息比对类型确定第一决算报表中相应类型的第一决算信息；基于决算比对策略将第一决算信息与第一预算比对表内相应的第一预算信息进行比对，得到第一比对结果；对第一预算报表的第一预算信息进行动态调整得到第二预算信息，统计所有的第二预算信息得到动态预算报表。