本发明涉及数据加密领域，具体涉及一种用于微服务的加密认证方法及系统。获取认证信息并转化为二进制，得到待加密数据；获取多个滤波模板并进行编号；获取待加密数据的滤波序列，获取滤波序列中每个数值对应编号的滤波模板；将待加密数据划分为对应多组数据，获取每组数据对应数值编号的滤波模板；将每组数据放入对应滤波模板中，获取每组数据在滤波模板中的位置，将相邻两组数据在滤波模板中的数据进行合并，获取待加密数据在滤波模板合并后的数值，得到加密数据，将加密数据进行传输，后台服务器对加密数据进行解密并比对认证。本发明通过构建滤波模板，并对待加密数据中的各组数据使用不同模板进行加密，有效增加了数据加密的复杂度。