本发明涉及海上风电技术领域，公开了一种海上风机导管架基础新型过渡段结构及疲劳计算方法，所述结构包括：顶板、底板、以及在所述顶板和所述底板之间设置的腹板、加强肘板、撑板、主腿、内环板和将军柱。本发明采用了腹板加强的结构型式，对大兆瓦风机新型过渡段结进行了设计和优化，相比传统箱梁式过渡段工程造价大幅降低，本过渡段结构可以为传递过来的风机荷载提供较好的承受力，能有效减少大兆瓦风机荷载引起的疲劳累积损坏，进一步地本发明可以准确的计算过渡段结构由风机载荷产生的疲劳累积损伤，精确地估算结构使用寿命，有效地预防服役期内结构因风机荷载等产生的疲劳破坏，为服役期内结构的安全性提供了有利的保障。