本发明涉及烟气净化技术领域，公开了一种喷氨量自动调节方法及系统。方法包括：基于预设主路喷氨流量调整主路流量调节阀的开度控制主路管道上的喷氨流量；基于工作分区的NOx浓度分布工况确定工作分区的预设分区喷氨流量；基于预设分区喷氨流量调整各个分区流量调节阀的开度控制工作分区的喷氨流量；根据工作分区的喷氨流量和预设关系模型确定管道喷头堵塞程度；基于管道喷头堵塞程度对分区流量调节阀的开度进行修正，直至将工作分区的喷氨流量调节至预设分区喷氨流量；在上述步骤中，还包括对SCR控制系统进行故障排除。本发明解决了现有脱硝系统因管道喷头堵塞或流量计故障引起喷氨流量异常，进而影响喷氨量控制的准确性的问题。