本发明公开了基于CECI算法的水稻植株深度学习计数数据集的创建方法，包括：采集原始水稻图片数据，对原始水稻图片进行植被色度筛选以及HSV空间色度分割处理，提取处理后原始水稻图片中的绿色水稻区域；将原始水稻图片进行色度增强，并对色度增强处理后的原始水稻图片进行十簇聚类；计算绿色水稻区域和十簇聚类分块后的重合率，根据重合率合并拼接得到最终的水稻图片；对最终的水稻图片进行腐蚀膨胀处理并计算水稻的连通域，根据连通域的重心坐标，对计算机自动标注生成的图片进行修正，创建数据集生成基准密度图。本发明方法为后续基于深度学习水稻植株计数方法的研究创造了基础。