本发明为一种基于自动同步离合器的旋转机械在线动平衡方法及结构，该方法包括：采集基于自动同步离合器的旋转机械的振动数据，根据振动数据确定动平衡块的位置和角度；控制自动同步离合器的主动盘和从动盘分离，与叶轮连接的从动盘旋转，主动盘静止，在主动盘上位于前述的位置和角度处施加平衡块，控制自动同步离合器的主动盘和从动盘啮合，完成旋转机械的在线动平衡处理。本发明可以实现在旋转机械不停机的情况下，用动平衡方法降低设备的振动，使振动参数达到标准范围，设备可以连续运行，避免机组停机带来的损失，并节省开机成本。