本发明涉及制造生产调度和路线统筹规划技术领域，特别涉及一种节能分布式两阶段装配零等待流水车间调度问题的优化系统，包括工件序列初始化模块、工厂优化模块、节能模块和资源分配均衡模块；工件序列初始化模块将头脑风暴优化算法中的聚类机制映射到产品分配中；工厂优化模块是通过调整产品和工作的顺序，优化产品的装配完成时间；节能模块是从第一个工件开始到最后一个工件结束，过程中没有空闲时间的连续工作路径称为关键路径；资源分配均衡模块是提出一种资源平衡方法，用工厂间设备利用率的标准差来表示资源分配的平衡；其有益效果是：本发明系统地分析了节能零等待流水车间调度的问题特性，将强化学习应用于工厂内和工厂间的工件移动策略。