一种基于高频闪光源的双相机快速空间轨迹捕获方法，通过高频频闪光光源在同步的双相机的一个曝光周期内发出多次脉冲闪光，使得采集到的图像上包含高速微粒子被高频光源照亮而捕获的一系列轨迹点，即两个平面轨迹和运动速度，每个轨迹点之间的时间间隔等于频闪光周期，进一步通过对图像进行处理与计算精确获得微粒子的对应的空间轨迹和运动速度。本发明通过同步的双相机与光源系统，精确快速完成高速微粒子空间轨迹捕获，能够明确监测高速微观尺度下粒子在碰撞之前的运动状态，对于无针注射、增材制造和空间防护过程的认知与状态调控具有非常重要的意义。