本发明公开了一种超大深基坑淤泥质地层二次筑岛土方开挖方法，包括如下步骤：(1)一次筑岛，所述一次筑岛标高为原地面标高；(2)开挖顶部冠梁支撑体系底标高以上土方，施做冠梁支撑体系；(3)二次筑岛，所述二次筑岛标高与支撑梁顶标高相同，并自出土口向二次修筑的中心岛引斜坡道；(4)岛式分段、分层、挖机阶梯式传递退挖支撑梁以下基坑淤泥质土层；(5)施作垫层，处理桩头，完成桩基检测工作，施作防水层；(6)分段及时封闭底板。在保证基坑开挖过程，围护结构支撑体系安全稳定的同时，提高淤泥质地层土方开挖外运效率，加快施工进度；减少临时工程费用投入，节省成本。