本发明提供一种微电网智能功率平衡控制系统，涉及微电网技术领域。该微电网智能功率平衡控制系统，包括终端发电调控子系统、电量统计模块和终端负荷调控子系统，所述终端发电调控子系统包括有功率调控模块、功率平衡模块、电压稳定模块和多通道整流模块，所述终端负荷调控子系统包括有用电量预测模块、时间限电模块和电量调控模块，所述功率调控模块包括有功率检测单元、功率调控单元、功率多流整合单元和功率保护单元。通过用电量的大小由功率调控单元对非再生能源发电与再生能源发电的功率比例进行调整，降低非再生能源发电的占比，以减少能源的损耗，可以对不同能源形式的电流进行整合，统一调整为三相交流电，以保证功率平衡。