一种控释二氧化氯的消毒组合物及其制备方法和应用，涉及化学消毒制品技术领域；包括芯层和包覆芯层的囊壁层，所述囊壁层包括亲水高分子聚合物，所述芯层包括质量比为20‑35：15‑25:0.1‑2的羟基甲亚磺酸单钠盐二水合物、亚氯酸盐和泡腾剂。本发明的消毒组合物，包括羟基甲亚磺酸单钠盐二水合物和亚氯酸盐，其可在水的作用下反应以产生二氧化氯，其原料安全性高，无环境污染，且可在水性介质中产生二氧化氯微泡，延长消毒时间，在长效、缓释方面性能优异，在食品和饮用水中消毒中具有较好的应用前景。