本公开涉及地下工程技术领域，提供了一种隧道减隔震结构的设计方法，通过对围岩进行勘测，能够由计算确定隧道各区域的抗震性能指标值；通过在设置于围岩和初支之间的第一隔震层，设置于初支和二衬之间的第二隔震层，以避免地震波对隧道内部支护结构直接作用，减小支护结构的振动响应；设置于浅层围岩区的第一注浆层和设置于深层围岩区的第二注浆层中选择一种或多种加强方式对隧道进行减隔震强化，够提高围岩自身抗震能力，从而提高支护结构的抗震能力。通过上述的隧道减隔震结构的设计方法，即能够根据抗震性能指标值对隧道减隔震结构进行精确配置；又能够避免对隧道断面进行扩挖，提升隧道结构的稳定性和整体性，有利于提升隧道的防水性能。