本发明涉及一种盾构掘进与既有顶管隧道位置冲突处理方法，在既有顶管隧道与新建盾构隧道冲突段的既有顶管隧道两端各建一座新建顶管工作井进行冲突范围局部迁改；对盾构掘进范围内的既有顶管隧道冲突段清除；对盾构施工强烈影响区范围内既有顶管隧道进行加固；通过在既有顶管隧道的冲突段两端新建两座新建顶管工作井，大大缩短迁改范围远，降低投资费用，缩短施工工期；开挖较深的基坑较浅、且不会对基坑周边造成太大的影响，具有很高的实用性；预先填充冲突段的既有顶管隧道，避免既有顶管隧道失稳坍塌造成事故；钻孔产生的清障孔采用粘性土回填和水泥砂浆回填配合夯实，满足盾构掘进过程中防止泥水压力冒浆要求。