本发明属于接地网拓扑结构探测技术领域，提供了一种变电站接地网水平拓扑结构探测方法及系统，通过向接地网内施加异频激励信号，然后对施加异频激励信号的接地网进行探测，通过取垂直于接地体方向的磁感应强度数据，分别按照行排列和列排列对相邻数据进行差值计算；根据差值计算，重新构建磁感应强度数据微分数组；对重新构建的磁感应强度数据微分数组做微分计算，得到接地网导体位置和拓扑结构；在施加异频激励信号的基础上，通过差值计算和微分计算，可快捷绘制变电站接地网水平拓扑结构，测量方法简单，检测精度高，且不受接地体深埋地表磁场强度衰减等问题的影响。