本发明提供了毛细针自动化更换装置和方法，所述自动化更换装置包括：夹持单元包括基座、第一夹爪、第二夹爪、导轨和驱动单元，所述第一夹爪和/或第二夹爪设置在所述导轨上，所述导轨设置在所述基座上，所述驱动单元用于驱动所述导轨上夹爪正向和反向移动；所述第一夹爪和第二夹爪上具有相对设置的允许所述毛细针进入的凹槽，自下而上地，位置相对的凹槽底壁间的距离变大；接口单元固定在所述基座上，且处于第一夹爪和第二夹爪之间；所述接口单元具有气体通道，导电体连接弹性件，并设置在所述气体通道内，第一密封件设置在所述导电体上，随着所述导电体的移动实现所述气体通道的开口端的开启和封闭。本发明具有更换准确等优点。