本发明公开了一种海洋牧场渔业碳汇评估模型的构建方法及应用，包括以下步骤：步骤一：在海洋牧场的养殖范围内划定样本区域；步骤二：对样本区域内的水产进行捕捞称重；步骤三:统计样本区域内的养殖水产种类及养殖水产的捕食种类；步骤四：根据步骤三的统计结果建立该样本区域的碳样本数据库；步骤五：根据碳样本数据库对海洋牧场养殖范围内的碳汇总量进行评估；本发明所构建的海洋牧场渔业碳汇评估模型，能够根据所碳样本数据库中的各体型的水产、浮游生物的生物量碳与个体体型间的函数关系，与海洋牧场养殖范围内养殖水产的预计总质量、水产的体型分布比例、被捕食的下级营养生物的质量及富有生物的质量对海洋牧场的碳汇总量进行评估。