本申请提供了一种种猪群体系谱的建立方法和建立装置，所述方法包括：针对目标环境下的预定个目标生物个体中的每个目标生物个体，获取该目标生物个体的染色体上的每个目标基因位点上的基因型；基于获取的每个目标生物个体的染色体上的每个目标基因位点上的基因型，获得每个目标生物个体对应的血统；针对所述预定个目标生物个体中的任意两个目标生物个体进行亲子关系分析，得到所述任意两个目标生物个体对应的亲子评价值；基于所述亲子评价值确定亲子对；确定每个亲子对的亲缘关系，并基于所述亲缘关系建立亲子关系图谱；基于所述亲子关系图谱和每个叶子节点对应的血统，建立以母系血统命名的种猪群体系谱。通过所述方法和装置，能够方便对种猪群体进行有效管理。