本发明公开了一种基于多智能体协同的储能集群指令自适应跟踪方法、系统、存储介质及电子设备，属于储能集群系统技术领域。过程为：构建包含多个同样储能单元的储能集群系统模型；获取外部指令；将外部指令分配到储能集群系统模型的每个储能单元中，每个储能单元根据分配得到的目标外部指令调节容量，使每个储能单元的容量与最大容量的比值相同，且各个储能单元充放电功率之和等于外部指令包括的分配功率；根据外部指令分配结果控制每个储能单元的充放电功率一致。从而实现多个储能单元的协同控制，保持多储能单元之间的充放电速度一直，防止储能单元因功率过大导致过热，进而延长储能单元寿命，提高了微电网的经济性，确定多个储能单元可同时退出微电网，提高储能集群系统的容量利用率。