本发明公开了一种快速开关型故障限流器的控制方法，所述快速开关和限流电抗器并联构成快速开关型故障限流器，所述快速开关型故障限流器与电网断路器串联连接；所述快速开关配置两组分闸驱动单元和两组合闸驱动单元；控制方法的实现如下：首先采集电网断路器电流、快速开关电流和快速开关位置，然后快速开关采用双分闸双合闸控制策略，结合限流电抗器的短路电流耐受能力和额定电流耐受能力进行综合判断，过负荷动作后控制电网断路器分闸。本发明克服了现有技术方案中限流电抗器只能长期运行的不足，提高了快速开关型故障限流器的可靠性和经济性。