本发明公开了一种淡紫拟青霉的羽碳双基双层微胶囊制剂的制备方法。将淡紫拟青霉菌粉与海藻酸钠水溶液混合，加入膨化鸡羽毛粉和生物炭搅拌，混合均匀后，送入喷雾干燥塔中，料液在离心雾化盘上雾化成小液滴，通过喷嘴喷入CaCl2水溶液中，固化后将海藻酸钙微球滤出，无菌水冲洗去除多余的CaCl2，然后将收集的微胶囊加入壳聚糖溶液中进行二次包衣，收集微胶囊风干，获得淡紫拟青霉的羽碳双基双层微胶囊制剂。本发明采用喷雾法结合钙离子固化法对淡紫拟青霉菌剂进行包埋，从而制成羽碳双基双层微胶囊，本发明采用的微胶囊包埋法条件温和且效率较高。