本发明属于非织造材料技术领域，涉及超细纤维屏蔽材料，特别涉及一种高强度超细纤维屏蔽材料及其制备方法和应用。具体公开了一种高强度超细纤维屏蔽材料，为双层/三层复合结构，具备微生物屏障。制备方法包含（1）纳米纤维预处理、（2）支撑层制备、（3）过滤层制备、（4）支撑层和过滤层后处理、（5）热压复合五个工序。制备方法便于操作、安全风险低，无污水废气排放、节能环保，无溶剂挥发、对操作人员无身体危害，成本较低且可稳定连续化生产。该材料具有高强度、高挺度、高阻隔等性能，可避免尖锐器物刺破，防水透气，经久耐用，在无菌医疗器械包装或医疗防护用品领域可广泛应用。