本发明公开了一种基于母线平衡的大数据关口故障智能诊断方法及系统，本发明包括构建电能表运行误差分析模型；以母线主变侧的关口电能表作为标准器构建近似电能表运行误差分析模型；利用母线主变侧的关口电能表与母线下所有的出线表的计量值建立电能表运行误差方程组，求解得到出线表的电能表运行误差，超过预设阈值则判定该出线表为影响母线平衡的出线表。本发明通过母线主变侧的关口电能表与母线下所有的出线表的计量值的大数据，可实现对影响母线平衡的出线表的快速定位，省去人工查找缺陷的过程，减轻自动化人员的工作量，缩短查找缺陷的时间，发现母线电量不平衡的潜在隐患点，实现缺陷的提前处置，极大地提高了母线平衡治理的效率和水平。