本发明公开了一种基于新能源多场站短路比的决策控制方法及系统，包括：计算电网中每个第一新能源场站的新能源多场站短路比，并基于所述新能源多场站短路比确定至少一个第二新能源场站；确定每个第二新能源场站的等效新能源功率控制目标；获取所述电网中的任一第一新能源场站到另一第一新能源场站的交互影响因子，并基于所述交互影响因子确定第三新能源场站；基于所述等效新能源功率控制目标，以新能源多场站短路比不越限为约束，以总体调整代价最小为优化目标，建立优化控制决策的最优化计算模型；求解所述最优化计算模型，确定第三新能源场站的有功功率调整量，以基于所述有功功率调整量进行调整，使得新能源多场站短路比不越限。