本申请实施例提供了一种体外膜肺氧合系统应急控制切换方法及装置，所述体外膜肺氧合系统中的泵驱动器和控制主机上均设置有控制面板，所述方法包括：确定控制主机的显示屏，输入按键和通讯是否出现故障；如果控制主机的显示屏，输入按键和通讯至少一个出现故障，则通过泵驱动器的泵控制器发送指令至泵驱动器的控制面板以激活泵驱动器的控制面板上的显示屏和输入按键；确定泵驱动器的控制面板上的显示屏和输入按键是否激活；如果激活，将控制主机的显示屏和输入按键功能通过泵控制器切换到泵驱动器的控制面板上。本申请实施例可以保证在手术时控制主机一旦出现异常以便保证手术的正常进行。